Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CREMQ03060 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CREMQ03060 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREMQ03060 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms