Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CENPEQ02224 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms