Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RHDQ02161 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHDQ02161 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHDQ02161 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHDQ02161 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms