Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms