Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms