Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms