Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP9P55211 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms