Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GEMP55040 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GEMP55040 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GEMP55040 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GEMP55040 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms