Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms