Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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