Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FNTAP49354 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FNTAP49354 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FNTAP49354 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms