Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NESP48681 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NESP48681 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NESP48681 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NESP48681 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NESP48681 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NESP48681 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms