Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSBP45954 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms