Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRPPRCP42704 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms