Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPS1P31327 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPS1P31327 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPS1P31327 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPS1P31327 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPS1P31327 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPS1P31327 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms