Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms