Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E1P29083 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms