Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms