Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XBP1P17861 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
XBP1P17861 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms