Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX6A1P12074 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX6A1P12074 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COX6A1P12074 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX6A1P12074 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms