Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSLP07711 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSLP07711 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSLP07711 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSLP07711 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms