Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPLO60437 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPLO60437 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPLO60437 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPLO60437 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPLO60437 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPLO60437 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms