Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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