Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms