Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BNH8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BNH8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H3BNH8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3BNH8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3BNH8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BNH8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3BNH8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms