Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E9PBE3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E9PBE3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E9PBE3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms