Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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