Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRCP1A6NGW2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms