Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF25A6NGN4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms