Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM149AA5PLN7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms