Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SSPOA2VEC9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms