Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MAP3K4Q9Y6R4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MAP3K4Q9Y6R4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
MAP3K4Q9Y6R4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
MAP3K4Q9Y6R4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAP3K4Q9Y6R4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms