Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAB39Q9Y376 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms