Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41L3Q9Y2J2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41L3Q9Y2J2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41L3Q9Y2J2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPB41L3Q9Y2J2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPB41L3Q9Y2J2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPB41L3Q9Y2J2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms