Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG2Q9UNQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG2Q9UNQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG2Q9UNQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms