Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX6Q9UNH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX6Q9UNH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX6Q9UNH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms