Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF223Q9UK11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF223Q9UK11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms