Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TSKSQ9UJT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSKSQ9UJT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSKSQ9UJT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms