Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBD1Q9UJT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms