Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF1Q9UBU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NXF1Q9UBU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXF1Q9UBU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms