Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OPTCQ9UBM4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPTCQ9UBM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms