Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL13Q9P2N7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms