Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHPF2Q9P2E5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHPF2Q9P2E5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHPF2Q9P2E5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHPF2Q9P2E5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms