Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBP1Q9NZI7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBP1Q9NZI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBP1Q9NZI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBP1Q9NZI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UBP1Q9NZI7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBP1Q9NZI7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBP1Q9NZI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBP1Q9NZI7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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