Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKIRAS1Q9NYS0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NKIRAS1Q9NYS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKIRAS1Q9NYS0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms