Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF38Q9NXL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF38Q9NXL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms