Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RLIMQ9NVW2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms