Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms