Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATG3Q9NT62 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ATG3Q9NT62 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms