Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDF3Q9NR23 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF3Q9NR23 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms